SYLLABUS ISABEE DFSTB: OUTILS ET METHODES D’EVALUATION DE LA BIODIVERSITE

ETB563OUTILS ET METHODES D’EVALUATION DE LA BIODIVERSITE
  1. Information du cours

Nom du cours, Unité d’Enseignement : Outils et méthodes d’évaluation de la biodiversité

Niveau : 5

Nom du Responsable du cours : Dr. Nguimkeng Gaintse Eric Dumas

Disponibilité et contact : en poste à ISABEE ; téléphone 694352045.

Date du cours ou période du cours : 1er Semestre

Découpage du cours (CM/TD/TP et TPE) : CM : 30 / TD/TP : 15 / TPE : 15

Nombre de crédits : 4

  • Description du cours

Objectifs pédagogiques :

  1. Définir le concept de biodiversité, analyser ses composantes ainsi que ses niveaux d’étude.
  2. Analyser quelques outils d’évaluation de la biodiversité.
  3. Etudier et mettre en application quelques méthodes d’inventaire de la biodiversité.
  4. Utiliser les indices de diversité pour la décrire : indice de Simpson, indice de Shannon.
  5. Utiliser les outils moléculaires d’analyse de diversité génétiques
  6. Etudier la diversité fonctionnelle et la phylogénétique

Contenus du cours :

Ce cours aborde le concept de biodiversité, l’analyse de ses composantes, quelques outils de mesure de la biodiversité : courbes d’accumulation, diversité asymptotique, taux de couverture et distribution d’abondance, les mesures neutres de diversité d’une communauté, les outils moléculaires d’analyse génétique et les notions de base de phylogénie

  • Apprentissages clés :

A la fin de ce cours, l’étudiant doit être capable de :

  • Participer aux grands débats internationaux sur les questions de biodiversité.
  • Participer ou diriger une équipe d’inventaire de la biodiversité.
  • Faire partir d’une équipe de recherche en biodiversité.
  • Faire valoir son expertise dans la gestion des écosystèmes forestiers.
  • Programme et calendrier
Semaine/dateContenus/objectifsActivitésTravail préalable
30/09/2024Séance 1 : Notion de diversité (définition, concept d’espèce, composantes et niveaux d’étude de la biodiversité)  CM  
31/09/2024Séance 2 : Outils d’évaluation de la biodiversité (courbes d’accumulation, diversité asymptotique, Taux de couverture, distribution d’abondance).CM et TD 
01/09/2024Séance 3 : Mesures neutres de diversité d’une communauté (Indice de Simpson, Indice de Shannon)CM et TD 
02/10/2024Séance 4 : Outils moléculaires d’analyse génétique (Notion de base, Outils, Analyses)CM et TD 
03/10/2024Séance 5 : Notions de base de phylogénie  CM et TD 
04/10/2024Séance 6 : Evaluation de la biodiversité floristique d’une parcelle du campusTP 
  • Mode d’évaluation
DatesType d’examen/compétences viséesPourcentage
 Travail Personnel de l’étudiant (exposé)10%
 Contrôle Continu : QCM, QRO20%
 Examen écrit : QCM, QRO, étude de cas70%
  • Règles et fonctionnement du cours

Règles générales

  • La présence en cours est obligatoire et contrôlée.
  • Les étudiants sont attendus pour participer activement aux discussions et aux activités en classe.
  • Les étudiants doivent respecter les délais de remise des travaux.

Retard dans la remise des travaux

  • Tout retard dans la remise des travaux sera pénalisé d’une façon suivante :
  • 1 jour de retard : 10% de pénalité sur la note finale
  • 2 jours de retard : 20% de pénalité sur la note finale
  • 3 jours de retard : 30% de pénalité sur la note finale
  • Les étudiants qui ne remettent pas leurs travaux dans les délais prescrits ne pourront pas obtenir une note supérieure à 60%.

Absentéisme

  • Tout absentéisme non justifié sera pénalisé d’une façon suivante :
  • 1 absence non justifiée : 10% de pénalité sur la note finale
  • 2 absences non justifiées : 20% de pénalité sur la note finale
  • 3 absences non justifiées : 30% de pénalité sur la note finale

Travail personnel

  • Les étudiants recevront des travaux personnels à réaliser entre les cours.
  • Ces travaux seront notés et compteront pour 10% de la note finale.

Plagiat

  • Tout plagiat sera sévèrement pénalisé.
  • Les étudiants qui commettent un plagiat seront sanctionnés d’une façon suivante :

Participation

  • Les étudiants sont attendus pour participer activement aux discussions et aux activités en classe.
  • Bibliographie et ressources complémentaires


Chapin M., 2004, « A Challenge to Conservationists », Worldwatch Magazine, novembre /décembre, pp. 17-31.

Marcon E., 2004, Mesure de la biodiversité. Miktex. 23P.

Books T. M. et alii, 2006, « Global Biodiversity Conservation Priorities », Science, 313, 5783,pp. 58-61.

Dinerstein E., Olson D. M., Graham D. J., 1995, A Conservation Assessment of the Terrestrial Ecoregions of Latin America and the Caribbean, Washington D. C., World Bank, 129 p.

Margules C. R., Pressey R. L., 2000, « Systematic Conservation Planning », Nature, 405, 6783, pp. 243-253.

Mittermeier R. A. et alii, 2003, « Wilderness and Biodiversity Conservation », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 100, 18, pp. 10309-

ETB563OUTILS ET METHODES D’EVALUATION DE LA BIODIVERSITE
  1. Information du cours

Nom du cours, Unité d’Enseignement : Outils et méthodes d’évaluation de la biodiversité

Niveau : 5

Nom du Responsable du cours : Dr. Nguimkeng Gaintse Eric Dumas

Disponibilité et contact : en poste à ISABEE ; téléphone 694352045.

Date du cours ou période du cours : 1er Semestre

Découpage du cours (CM/TD/TP et TPE) : CM : 30 / TD/TP : 15 / TPE : 15

Nombre de crédits : 4

  • Description du cours

Objectifs pédagogiques :

  1. Définir le concept de biodiversité, analyser ses composantes ainsi que ses niveaux d’étude.
  2. Analyser quelques outils d’évaluation de la biodiversité.
  3. Etudier et mettre en application quelques méthodes d’inventaire de la biodiversité.
  4. Utiliser les indices de diversité pour la décrire : indice de Simpson, indice de Shannon.
  5. Utiliser les outils moléculaires d’analyse de diversité génétiques
  6. Etudier la diversité fonctionnelle et la phylogénétique

Contenus du cours :

Ce cours aborde le concept de biodiversité, l’analyse de ses composantes, quelques outils de mesure de la biodiversité : courbes d’accumulation, diversité asymptotique, taux de couverture et distribution d’abondance, les mesures neutres de diversité d’une communauté, les outils moléculaires d’analyse génétique et les notions de base de phylogénie

  • Apprentissages clés :

A la fin de ce cours, l’étudiant doit être capable de :

  • Participer aux grands débats internationaux sur les questions de biodiversité.
  • Participer ou diriger une équipe d’inventaire de la biodiversité.
  • Faire partir d’une équipe de recherche en biodiversité.
  • Faire valoir son expertise dans la gestion des écosystèmes forestiers.
  • Programme et calendrier
Semaine/dateContenus/objectifsActivitésTravail préalable
30/09/2024Séance 1 : Notion de diversité (définition, concept d’espèce, composantes et niveaux d’étude de la biodiversité)  CM  
31/09/2024Séance 2 : Outils d’évaluation de la biodiversité (courbes d’accumulation, diversité asymptotique, Taux de couverture, distribution d’abondance).CM et TD 
01/09/2024Séance 3 : Mesures neutres de diversité d’une communauté (Indice de Simpson, Indice de Shannon)CM et TD 
02/10/2024Séance 4 : Outils moléculaires d’analyse génétique (Notion de base, Outils, Analyses)CM et TD 
03/10/2024Séance 5 : Notions de base de phylogénie  CM et TD 
04/10/2024Séance 6 : Evaluation de la biodiversité floristique d’une parcelle du campusTP 
  • Mode d’évaluation
DatesType d’examen/compétences viséesPourcentage
 Travail Personnel de l’étudiant (exposé)10%
 Contrôle Continu : QCM, QRO20%
 Examen écrit : QCM, QRO, étude de cas70%
  • Règles et fonctionnement du cours

Règles générales

  • La présence en cours est obligatoire et contrôlée.
  • Les étudiants sont attendus pour participer activement aux discussions et aux activités en classe.
  • Les étudiants doivent respecter les délais de remise des travaux.

Retard dans la remise des travaux

  • Tout retard dans la remise des travaux sera pénalisé d’une façon suivante :
  • 1 jour de retard : 10% de pénalité sur la note finale
  • 2 jours de retard : 20% de pénalité sur la note finale
  • 3 jours de retard : 30% de pénalité sur la note finale
  • Les étudiants qui ne remettent pas leurs travaux dans les délais prescrits ne pourront pas obtenir une note supérieure à 60%.

Absentéisme

  • Tout absentéisme non justifié sera pénalisé d’une façon suivante :
  • 1 absence non justifiée : 10% de pénalité sur la note finale
  • 2 absences non justifiées : 20% de pénalité sur la note finale
  • 3 absences non justifiées : 30% de pénalité sur la note finale

Travail personnel

  • Les étudiants recevront des travaux personnels à réaliser entre les cours.
  • Ces travaux seront notés et compteront pour 10% de la note finale.

Plagiat

  • Tout plagiat sera sévèrement pénalisé.
  • Les étudiants qui commettent un plagiat seront sanctionnés d’une façon suivante :

Participation

  • Les étudiants sont attendus pour participer activement aux discussions et aux activités en classe.
  • Bibliographie et ressources complémentaires


Chapin M., 2004, « A Challenge to Conservationists », Worldwatch Magazine, novembre /décembre, pp. 17-31.

Marcon E., 2004, Mesure de la biodiversité. Miktex. 23P.

Books T. M. et alii, 2006, « Global Biodiversity Conservation Priorities », Science, 313, 5783,pp. 58-61.

Dinerstein E., Olson D. M., Graham D. J., 1995, A Conservation Assessment of the Terrestrial Ecoregions of Latin America and the Caribbean, Washington D. C., World Bank, 129 p.

Margules C. R., Pressey R. L., 2000, « Systematic Conservation Planning », Nature, 405, 6783, pp. 243-253.

Mittermeier R. A. et alii, 2003, « Wilderness and Biodiversity Conservation », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 100, 18, pp. 10309-

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