Microbiologie Spéciale (Mycologie, Virologie et Bactériologie)

Code UE	Intitulé de l’UE	Volume horaire					Crédits
		CM	TD	TP	TPE	Total
UEs Fondamentales
BPA438	Microbiologie Spéciale (Mycologie, Virologie et Bactériologie)	50	10	20	10	90	6

1. Information du cours

Nom du cours, Unité d’Enseignement et Niveau : Microbiologie spéciale (Mycologie, bactériologie et virologie)

Nom du Responsable du cours : Dr MBOUOMBOUO Mama

Disponibilité et contact : 690241655

Date du cours ou période du cours : 1^er semestre

Découpage du cours (CM/TD/TP et TPE) : CM : 50 TD : 10 TP : 20 TPE : 10

Nombre de crédits : 6

• Description du cours

Le cours de microbiologie spéciale permet aux étudiants d’avoir une compréhension approfondie des micro-organismes pathogènes, notamment les virus, les bactéries et les champignons qui affectent les végétaux. Les étudiants apprendront les principes fondamentaux de la virologie, de la bactériologie et de la mycologie des plantes, ainsi que les méthodes de diagnostic et de contrôle des maladies des plantes.

Objectifs pédagogiques :

À la fin de ce cours, les étudiants seront capables de: 

1) Acquérir des connaissances fondamentales et appliquées sur les micro-organismes (champignons, bactéries et virus) interagissant avec les plantes, en mettant l’accent sur leur rôle dans les maladies des plantes, mais aussi sur leurs aspects bénéfiques.  

Comprendre les caractéristiques et les propriétés des virus, des bactéries et des champignons pathogènes des plantes

2) Identifier et maitriser la biologie des bactéries, des virus et des champignons pathogènes  des plantes, des maladies qu’elles causent et de leur isolement, transmission et gestion.

3) Faire un diagnostic des maladies virales et bactériennes des plantes et des semences.

Contenu :

Le cours de microbiologie spéciale couvre les aspects tels que Nature des virus végétaux, réplication, expression génique, transmission, sérologie et gestion. Identification et biologie des bactéries pathogènes végétales, des maladies qu’elles causent et de leur isolement, transmission et gestion. Diagnostic des maladies, fongiques, virales et bactériennes des plantes et des semences.

Apprentissages clés :

1. Comprendre les caractéristiques et les propriétés des virus, des bactéries et des champignons
2. Maitriser les interactions entre les micro-organismes et les plantes
3. Connaissance des principes fondamentaux de la microbiologie des plantes

Compétences visées :

1. Capacité à identifier et à caractériser les virus, les bactéries et les champignons qui  affectent les plantes
2. Capacité à collecter et à analyser des échantillons de plantes pour détecter les maladies

• Programme et calendrier

Semaine/date	Contenus/objectifs	Activités	Travail préalable
Du…..au…	Bactériologie des plantes	Caractéristiques générales des bactéries, morphologie, physiologie et classification. Nutrition et culture des bactéries Différentes bactéries pathogènes des végétaux Méthodes de diagnostic et de lutte contre les maladies bactériennes des plantes	Lecture des documents
	Les bactéries phytopathogènes	Mécanismes d’infection, symptômes des maladies, transmission. Principales maladies bactériennes des plantes Diagnostic et méthodes de lutte.	Lecture et rappel du chapitre précédent
	Virologie des végétaux	Caractéristiques générales des virus, structure, classification, multiplication	Lecture et rappel du chapitre précédent
	Virus phytopathogènes et Maladies virales	Mécanismes d’infection, transmission (vecteurs, greffage, semences), symptômes des maladies Exemples de maladies courantes (mosaïques, jaunisses, enroulements, etc.) Diagnostic et méthodes de lutte.	Lecture et rappel du chapitre précédent
	Mycologie des plantes	Introduction à la mycologie Caractéristiques générales des champignons Morphologie, reproduction et classification.	Lecture et rappel du chapitre précédent
	Les champignons phytopathogènes et maladies fongiques	Cycles de vie, mécanismes d’infection, symptômes des maladies Maladies courantes (mildious, rouilles, oïdiums, fusarioses, etc.), Diagnostic et méthodes de lutte.	Lecture et rappel du chapitre précédent
	Champignons bénéfiques pour les plantes	Mycorhizes, endophytes, rôle dans la croissance et la protection des plantes	Lecture et rappel du chapitre précédent

• Mode d’évaluation

Dates	Type d’examen/compétences visées	Pourcentage
	Travail Personnel de l’étudiant (exposé)	10%
	Contrôle Continu : QCM, QRO	20%
	Examen écrit : QCM, QRO, étude de cas	70%

• Règles et fonctionnement du cours

Règles générales

• La présence en cours est obligatoire et contrôlée.
• Les étudiants sont attendus pour participer activement aux discussions et aux activités en classe.
• Les étudiants doivent respecter les délais de remise des travaux.

Retard dans la remise des travaux

• Tout retard dans la remise des travaux sera pénalisé d’une façon suivante :
• 1 jour de retard : 10% de pénalité sur la note finale
• 2 jours de retard : 20% de pénalité sur la note finale
• 3 jours de retard : 30% de pénalité sur la note finale
• Les étudiants qui ne remettent pas leurs travaux dans les délais prescrits ne pourront pas obtenir une note supérieure à 60%.

Absentéisme

• Tout absentéisme non justifié sera pénalisé d’une façon suivante :
• 1 absence non justifiée : 10% de pénalité sur la note finale
• 2 absences non justifiées : 20% de pénalité sur la note finale
• 3 absences non justifiées : 30% de pénalité sur la note finale

Travail personnel

• Les étudiants recevront des travaux personnels à réaliser entre les cours.
• Ces travaux seront notés et compteront pour 10% de la note finale.

Plagiat

• Tout plagiat sera sévèrement pénalisé.

Participation

• Les étudiants sont attendus pour participer activement aux discussions et aux activités en classe.
• Bibliographie et ressources complémentaires

Albach, R.A. and Booden, T. 1978. Amoebae. In: Parasitic Protozoa, Vol II (ed. J.P. Kriep). Academic Press. London.

Alexopoulos, C. J and Mims, C. W. 1996. Introductory Mycology, 4th Ed.

Carroll, G.C. and Wicklow, D.T. 1992. The Fungal Community: Its Organization and Role in the Ecosystem. Marcel Deker, Inc., N.Y.

Cox, F. E. G. 2001. Modern parasitology. Blackwell Sciences.

Curd, C.R. 1992. Protozoa and the water industry. Cambridge University Press, MA.

Deacon, J.W. (2005). Fungal Biology (4th ed). Malden, MA: Blackwell P ublishers.

Frobisher, M., Hinsdill R. D., K., Crabtree T. and Goodheart, C.R. 1974. Fundamentals of Microbiology. Ninth Edition. Philadelphia: Saunders College Publishing.

Gelderblom, H.R. 1996. Structure and Classification of Viruses in Medical Microbiology. Samuel Baron ed. University of Texas Medical Branch at

Galveston.

Isaac, S., Frankland, J.C., Watling, R. and Whalley, A.J.S. 1993. Aspects of Tropical Mycology. Cambridge University Press, Cambridge, UK.

Mader, S.S. 2004. Biology. McGraw-Hill Companies, Inc.. 1221. Avenue of the Americas, NY 10020.